I prodotti farmaceutici appartengono alla categoria dei rifiuti pericolosi, quindi è obbligatoria la loro raccolta differenziata. La pericolosità dei farmaci è dovuta principalmente al fatto che dalla decomposizione delle sostanze in essi presenti si possono formare altre sostanze dannose per la salute dell'uomo e dell'ambiente. I principi attivi contenuti nei medicinali devono essere correttamente smaltiti; se gettati insieme ai rifiuti domestici finiscono nella discarica, dove possono dare luogo ad emissioni nocive ed inquinare il percolato, liquido che si accumula sul fondo della discarica. È perciò necessario smaltire questi rifiuti in discariche appositamente controllate o negli impianti di combustione.